Phú Yên hiện có 6 tuyến quốc lộ với tổng chiều dài gần 463km, trong đó có 134km QL1A trải dài từ đèo Cù Mông đến đèo Cả; gần 14km QL1D nối liền hai tỉnh Phú Yên - Bình Định; 70km QL25; 111km QL29 kết nối vùng duyên hải Nam Trung bộ với Tây Nguyên; 111km QL19C nối Bình Định với Đăk Lắk và gần 20km đường Trường Sơn Đông nối Quảng Nam với Lâm Đồng.